La secuenciación del genoma completo del virus SARS-CoV-2 en aguas residuales nos ha permitido monitorizar las diferentes variantes circulantes en la población de la ciudad de Valencia. Debido a que cada vez hay menos disponibilidad de datos genómicos de muestras clínicas y además, únicamente corresponden a individuos con sintomatología grave, es ahora cuando la monitorización de las variantes presentes en aguas residuales cobra mayor relevancia ya que permite tener una fotografía más amplia de la situación recogiendo incluso el avance de las variantes que, por lo general, se consideran asintomáticas.
El Laboratorio GAMASER (áreas específicas de secuenciación y SARS) e I+D+i Servicios ha presentado el póster “Monitorización y prevalencia de las variantes de SARS-CoV-2 presentes en el agua residual de Valencia” en la X Jornada de Bioinformática y Genómica celebrada en la Universidad de Valencia y organizada por la Sociedad Catalana de Biología el pasado 15-16 de Diciembre.
Este trabajo está dentro del marco del proyecto de I+D+i Atalaya (Identificación y cuantificación de contaminantes emergentes en aguas residuales (virus y fármacos) y posibles repercusiones en la calidad de las aguas).
El trabajo interdisciplinar de cuantificación del virus en muestras de aguas residuales mediante PCR a tiempo real y la secuenciación de las diferentes variantes circulantes en la muestra, así como la utilización de un algoritmo bioinformático para analizar los resultados forman una potente herramienta para el seguimiento epidemiológico del virus SARS-CoV-2 en la población.
Este trabajo aporta beneficios a, tanto a las autoridades sanitarias para ayudar a la toma de decisiones respecto al abordaje de esta pandemia, como a la comunidad científica para aumentar el conocimiento que se tiene de las diferentes variantes circulantes del virus.
Esta herramienta de vigilancia epidemiológica que ha servido de antesala para nuevos proyectos de evaluación de la calidad de las aguas o de la situación sanitaria de la población a través de la secuenciación de distintos tipos de agua.
La técnica de secuenciación es una herramienta muy potente que, aplicada al análisis de distintos tipos de aguas, nos permite obtener mucha información sobre el estado de salud de la población y calidad de las aguas. Mediante secuenciación podemos, por ejemplo, conocer la composición de virus, bacterias y protozoos de determinadas zonas e incluso identificar las diferentes resistencias a antibióticos circulantes en la actualidad.
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